الف- اهداف(کوتاه مدت)
1. تولید علم در حوزه دفاع و امنیت با رویکرد بنیادی مبتنی بر آموزه های دینی؛
2. پاسخ به نیازهای پژوهشی کشور در زمینه دفاع و امنیت در اسلام؛
3. زمینه سازی مناسب برای ارتقاء فعالیت های بنیادی پژوهشی در چارچوب اهداف نظام اسلامی؛
4. مشارکت در تحول بنیادی علوم انسانی بر پایه الگوی ایرانی- اسلامی پیشرفت؛
5. تلاش در جهت تحقق سند چشم انداز و نقشه علمی کشور؛
6. ارائه نظریه یا روش جدید در پاسخ به مسائل حوزه اندیشه های بنیادی با هدف تأمین و بسط بنیادهای تئوریک دفاعی- امنیتی نظام اسلامی؛
7. زمینهسازی برای دفاع علمی و پاسداری هوشمندانه از نظام اسلامی و دستاوردهای آن، از طریق ایجاد زیربناهای فکری و پشتوانههای علمی بنیادی؛
8- ارتقای سطح علمی جامعه در خصوص مسائل دفاعی- امنیتی و کاربست راه کارهای استخراج شده در سطوح مختلف اجتماع.
و...
ب- چشم انداز(اهداف بلند مدت)
1. دستیابی به اجرای منویات و ایده های امام و رهبری؛
2. تحقق اهداف سند چشم انداز و سایر اسناد بالادستی نظام؛
3. بالندگی علمی انقلاب اسلامی و نظام جمهوری اسلامی؛
4. دستیابی به مرجعیت علمی در عرصه های دفاعی و امنیتی اسلام؛
5.تلاش در راستای ماندگاری انقلاب اسلامی و نظام جمهوری اسلامی ایران؛
و ...